留坝县真菌研究所创建于一九九五年十月,是集菌类等植物研究、技术推广、技术咨询服务为一体的非营利性科技企业。主要从事食用菌、药用菌、名贵中药材品种选育菌种生产、栽培新技术研究及推广。

  研究所建有规范化的实验室，下设一个菌种厂，一个品种对比选育场，三个培训中心（食用菌培训中心、天麻技术培训中心、猪苓栽培技术培训中心）和二个栽培实验基地。研究所现有员工13人，其中，高级职称3人，技术员6人，特聘陕西理工学院教授陈文强、邓百万、彭浩、李树森为技术顾问。研究所拥有自己的独立网站及注册商标。

  研究所2003年创建了“留坝县芥菜沟万窝猪苓人工半野生栽培示范园”，获得了很好的效果，为带动和指导我国猪苓大规模半野生人工栽培取得了宝贵经验。研究所通过对猪苓的生长环境和生理习性的研究，使栽培技术有了新的突破，对促进我国猪苓生产大发展起到了领航作用。2008年研究所荣获汉中市优秀民营企业。为推动农村科技的发展，研究所每年举办菌业培训班及现场指导60余场次，被应邀县外技术传授10多次。猪苓栽培技术推广到全国13个省市，年发放栽培猪苓技术资料20000余份,接受咨询服务2000余次。先后研究推出了猪苓种秦正1#、秦正2#；猪苓蜜环菌秦正M1#、秦正M3#；黑木耳、香菇、天麻伴生菌（密环菌、萌发菌  ）、平菇、金针菇、竹荪、雷丸、羊肚菌等珍稀菇类等 30 余个品种 、100 余个菌株。2009年研究所参与制定了《陕西省猪苓栽培技术标准》，填补了猪苓人工栽培技术规范的空白。尤其以猪苓菌菌株选育及栽培方面的独特见解和实用技术领先于国内同行业水平。研究所多次获得科技成果奖和优秀先进荣誉称号。